氟因其特有的化學(xué)性質(zhì),在新藥開發(fā)中應(yīng)用廣泛。在FDA批準(zhǔn)上市的含氟藥物中,氟以ArF、AlkF、ArCF3等多種結(jié)構(gòu)形式存在,用于改善藥物的體內(nèi)外活性。
氟的化學(xué)特性:
1、 氟原子的范德華半徑比氫原子大約20%。C-F的鍵長與C=O相近,比C-H鍵更長,比C-OH、C-C≡N,以及S=O更短。
2、 氟的電負(fù)性跟氧接近。C-F鍵比C-H鍵的偶極矩大(方向相反),比C=O鍵、S=O鍵、C-OH鍵,C-C≡N鍵的偶極矩小。
3、 氟的親脂性比氫原子略大,且遠(yuǎn)大于OH、C=O、C≡N、亞砜以及砜取代基。
4、 與氯、溴、碘不同,氟不能形成鹵鍵,且具有很低的可極化性。
這些化學(xué)特性使得氟原子可以引入藥物分子中,用來改善藥物的生物利用度和生物選擇性。(DOI: 10.1021/acs.jmedchem.7b01788)
1、 氟替代烷烴氫原子
默克公司在開發(fā)用于治療肥胖癥的hBRS-3受體激動(dòng)劑MK-5046過程中,將分子中的叔丁基替換成三氟甲基環(huán)丙烷結(jié)構(gòu),將-CH3替換成-CF3,增強(qiáng)了藥物分子的親脂性以及代謝穩(wěn)定性。(ACS Med. Chem.Lett. 2011, 2, 43?47. )
2、ArF與ArCF3
2014年,葛蘭素史克(GlaxoSmithKline)公司的Martin等在J. Med. Chem上發(fā)表了對丙肝病毒(HCV)NS5B抑制劑Tegobuvir的優(yōu)化過程,其中,A環(huán)和D環(huán)的均引入含氟基團(tuán)。對比數(shù)據(jù)說明,苯環(huán)上氟的取代位置對藥物的抗病毒效用影響大。(J. Med. Chem. 2014, 57, 1964?1975.)
3、 N-CF3
N-三氟甲基取代胺可以調(diào)節(jié)分子堿性,從而影響分子的藥物動(dòng)力學(xué)性質(zhì),經(jīng)常被用在藥物設(shè)計(jì)中。日本杏林制藥公司根據(jù)廣譜抗菌藥諾氟沙星(Norfloxacin)的構(gòu)效關(guān)系,用三氟甲基、甲基替代乙基,得到其類似物275、276,并檢測其體外抗菌活性。結(jié)果表明,類似物276與諾氟沙星的抗菌能力相當(dāng)。(J. Med. Chem. 2005, 48, 3443?3446.)
4、 1,1-二氟乙烯基與C=O
法國國家科研中心的Magueur G團(tuán)隊(duì)將青蒿素的羰基用1,1-二氟乙烯基替代得到化合物347,使藥效活性提高近兩倍。(J. Fluorine Chem. 2006, 127, 637?642.)
5、 RCF2CH2NHR’與磺酰胺(RSO2NHR’)
雖然還沒有大量的研究實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證RCF2CH2NHR’能夠作為磺酰胺(RSO2NHR’)生物電子等排體,但是強(qiáng)生公司的Lily Lee等,在2007年發(fā)表的對凝血酶抑制劑的開發(fā)實(shí)驗(yàn)中給我們一個(gè)實(shí)例,證明兩者為潛在的化學(xué)性質(zhì)相似結(jié)構(gòu)。(Bioorg. Med. Chem. Lett. 2007,17, 6266?6269.)
6、 CHF2與SH
IRBM.MRL Rome公司的Frank Narjes等在開發(fā)丙型肝炎病毒NS3抑制劑過程中,將化合物450中的SH用立體結(jié)構(gòu)相似CHF2替換,得到抑制活性增強(qiáng)的化合物452。(Bioorg. Med. Chem. Lett. 2002, 12, 701?704)
7、 CHF2 與OH
阿爾伯塔大學(xué)的Edward E. Knaus課題組以環(huán)氧化酶(COX-2)抑制劑——Celecoxib為先導(dǎo)化合物,設(shè)計(jì)合成了環(huán)氧酶與5-脂氧合酶的雙重抑制劑471。用OH替代CHF2,得到抑制活性相近的化合物472。(J. Med. Chem. 2009, 52,1525?1529.)
8、 氟原子與腈基
默克公司的Timo Heinrich等在研究抗抑郁的5-HT1A受體激動(dòng)劑vilazodone過程中,在吲哚苯環(huán)上引入F原子得到化合物552,經(jīng)過一系列的實(shí)驗(yàn)表明,化合物552與vilazodone的生物活性相似。(J. Med. Chem. 2004, 47, 4684?4692.)
9、SF5基團(tuán)
SF5是藥物分子設(shè)計(jì)中常用的取代基。與CF3相比,SF5有更大的親脂性、電負(fù)性以及化學(xué)穩(wěn)定性。阿伯丁大學(xué)的Matteo Zanda課題組嘗試在大麻素配體中引入SF5,并與三氟甲基和叔丁基進(jìn)行了數(shù)據(jù)對比,SF5化合物557對CB1受體的作用是CF3化合物556的兩倍。(RSC Adv. 2014,